Аналіз відкриває нові докази глобального сплеску стрептококової інфекції групи А

Стрептококи групи А (Strep A) – поширений тип бактерій, які зазвичай викликають інфекції горла та скарлатину стиль>. Хоча більшість інфекцій є легкими, у рідкісних випадках стрептокок А може спричинити інвазивні інфекції, які можуть бути летальними.

Між 2022 і 2023 роками служби охорони здоров’я в усьому світі зафіксували сплеск важких інвазивних стрептококових інфекцій після скасування пандемічних обмежень. Нове дослідження вчених з Імперського коледжу Лондона та Агентства громадської охорони здоров’я Великобританії підтвердило, що бактеріальний варіант під назвою M1UK відіграв ключову роль у цьому збільшенні.

Відомо, що штами M1 спричиняють більш інвазивні інфекції порівняно з іншими типами стрептококу А. Незважаючи на те, що цей варіант було вперше виявлено та секвеновано у Великій Британії, M1UK нещодавно асоціювали зі збільшенням тяжких інфекцій у Європі, Австралії та Північній Америці і Японії після скасування пандемічних обмежень. Його також знайшли в Південній Америці, Новій Зеландії та Тайвані.

З-за низького рівня зараження стрептококом А під час пандемії населення, особливо діти, стали особливо вразливими до цих інфекцій, що сприяло різкому зростанню випадків у багатьох країнах.

У новому дослідженні генетики M1UK, опублікованому в Nature Communications, вчені надають нові дані про те, коли вперше з’явився варіант і як він порівнюється з іншими штамами.

Глобальне поширення та можливі інтродукції M1UK і проміжних популяцій. Філогенетичне дерево 2364 штамів M1UK і проміжних штамів, зібраних по всьому світу з березня 2005 по липень 2023. B Спрощене дерево передачі, створене за допомогою PastML, що показує місце походження епідемії предків ліній M1UK і проміжних популяцій. C Оцінка ефективного розміру популяції (Ne) M1UK у Великобританії з часом. Nature Communications (2024). DOI: 10.1038/s41467-024-47929-7

Використовуючи генетичне секвенування зразків пацієнтів у поєднанні з комп’ютерним моделюванням, вони виявили, що M1UK, ймовірно, з’явився приблизно у 2008 році та почав поступово зростати з 2010 року.

Порівняно з попередніми штамами M1, які залишалися відносно незмінними протягом останніх 40 років, M1UK виробляє більше токсинів, які викликають скарлатину.

Професор Шірані Сріскандан з кафедри інфекційних хвороб Імперського коледжу Лондона, який очолював дослідження разом із колегами з UKHSA, сказав: «Бактерії еволюціонують з часом, і оскільки Strep A є виключно людським патогеном, він набуває генетичних змін, оскільки поширюється серед населення. Більшість варіантів з часом з’являються та зникають, однак M1UK, схоже, зараз прижився у Великобританії та інших країнах. Чи залишиться це в довгостроковій перспективі, невідомо».

Генетична історія

Використовуючи пошук у глобальних геномних базах даних, команда показала, що коли M1UK було вперше виявлено у Великобританії в 2019 році, лише два штами M1UK можна було ідентифікувати з геномних послідовностей за межами Великобританії. Але подальший аналіз в інших країнах, що вивчає зміну тенденцій стрептококової інфекції (включаючи інвазивні інфекції), показує, що зараз M1UK присутній у понад 10 країнах світу, а в деяких випадках став домінуючим штамом у постпандемічний період. p>

Аналіз також підкреслює ефект вузького місця, через який зараження стрептококом А знизилося під час пандемії COVID-19, що збіглося з широко поширеними заходами соціального дистанціювання та карантином. Але після цього періоду M1UK швидко поширився у Великій Британії, із помітним збільшенням випадків скарлатини та інвазивних стрептококових інфекцій у 2022 році.

На думку дослідників, хоча зниження рівня передачі стрептокока А під час пандемії могло призвести до ослаблення імунітету населення, їхня робота підкреслює генетичні особливості M1UK, які вказують на перевагу життєздатності над іншими штамами, дозволяючи йому легше поширюватися та потенційно можуть викликати більш серйозні захворювання. Хвороби. Можливо, підвищення імунітету населення до штаму M1UK може призвести до появи інших типів штамів.

Професор Сріскандан, також клінічний директор Центру біології бактеріальної резистентності, додав: «Хоча ми тепер знаємо, що варіант M1UK відповідальний за значне збільшення випадків минулої зими, це сталося в незвичайний час року, який збігся з респіраторні віруси та зимовий стрес. Що все сприяло тяжкості. Зрештою, спалахи, які ми спостерігаємо в різний час у всьому світі, ймовірно, пов’язані зі зниженням імунітету до певних респіраторних патогенів, особливо до стрептококу А. Вакцини можуть допомогти запобігти цьому, і нам справді потрібна вакцина проти стрептококу А. Ці останні висновки Наше дослідження було стало можливим завдяки тісній співпраці між дослідниками інфекційних хвороб з Імперського коледжу та провідною у світі системою молекулярного спостереження Агентства громадської охорони здоров’я Великобританії».