Дослідження: гени впливають на протиракову ефективність фруктів і клітковини

Нещодавнє дослідження, опубліковане в журналі eBioMedicine, виявило генетичні варіації, які можуть змінювати зв'язок між споживанням клітковини, фруктів та овочів і ризиком розвитку колоректального раку (КРР). Дослідникам вдалося успішно визначити два значущі локуси, що змінюють зв'язок між споживанням клітковини та фруктів і ризиком розвитку КРР.

Коронний рак (КОР) є одним із найпоширеніших видів раку у світі, з майже двома мільйонами нових випадків та понад 900 000 смертей у 2020 році. Повідомлялося, що високе споживання фруктів, овочів, цільного зерна та харчових волокон знижує ризик КОР. Хоча існують вагомі докази зв'язку між ризиком КОР та споживанням цільного зерна та харчових волокон, докази зв'язку між ризиком КОР та споживанням фруктів та овочів залишаються обмеженими.

Попередні дослідження асоціації геному (GWAS) виявили щонайменше 200 локусів, пов'язаних з ризиком колоректального раку, що пояснює до 35% успадковуваності. Хоча взаємодії ген-середовище (G × E) можуть пояснити додаткову успадковуваність, попередні дослідження з невеликими вибірками та традиційними методами виявили лише обмежену кількість значущих взаємодій. Нові статистичні підходи, такі як кон'юнтні тести та двоетапні методи, що пріоритезують однонуклеотидні поліморфізми (SNP), мають потенціал для підвищення точності цих аналізів.

До аналізу було включено до 45 досліджень трьох генетичних консорціумів з колоректального раку, що включали осіб європейського походження. Дослідження включали набори випадок-контроль для когортних досліджень та контрольну групу без раку для досліджень випадок-контроль. Загалом було проаналізовано споживання фруктів, овочів та клітковини 69 599, 69 734 та 44 890 учасників відповідно. Споживання їжі оцінювали за допомогою анкет щодо частоти споживання їжі та історії харчування, зазвичай виражаючи це в порціях на день для фруктів та овочів і грамах на день для загальної клітковини.

Дані були гармонізовані та виражені у вигляді квартильних значень за статтю та дослідженням. Крім того, контроль якості генотипування включав перевірку на наявність відсутніх даних, рівноваги Харді-Вайнберга та невідповідності статей, а потім імпутацію та фільтрацію на частоту та точність мінорних алелів, що призвело до аналізу 7 250 911 SNP.

Порівняно з контрольною групою, учасники з колоректальним раком були старшими, мали вищий індекс маси тіла та споживання енергії, а також вищу поширеність факторів ризику, таких як сімейний анамнез колоректального раку та діабету 2 типу. Вони також споживали менше клітковини, фруктів та овочів порівняно з контрольною групою. Мета-аналізи виявили зворотний зв'язок між споживанням клітковини (відносний ризик на квартиль збільшення (ВШ) = 0,79), фруктів (ВШ = 0,79) та овочів (ВШ = 0,82) та ризиком колоректального раку.

Тест 3-DF ідентифікував локус rs4730274 вище за течією від гена SLC26A3, що показує зв'язок зі споживанням клітковини та взаємодію з ризиком колоректального раку. Стратифікація за генотипом показала сильніший зворотний зв'язок між клітковиною та колоректальним раком для кожної копії алеля T. Функціональна анотація свідчить про активність енхансера в тканинах товстої кишки з eQTL для гена DLD.

Локус rs1620977 поблизу гена NEGR1 показав значний зв'язок зі споживанням фруктів та помірну взаємодію з ризиком колоректального раку. Сильні зворотні зв'язки спостерігалися зі збільшенням споживання фруктів для кожної копії алеля G.

Це найбільше дослідження G×E на сьогоднішній день, у якому дослідники виявили дві взаємодії між клітковиною, споживанням фруктів та ризиком колоректального раку. Зокрема, rs4730274 поблизу гена SLC26A3 свідчить про значний зв'язок між споживанням клітковини, функцією кишечника, запаленням та колоректальним раком. Результати вимагають подальших досліджень для вивчення клінічних наслідків та підтвердження цих висновків у різних популяціях.