Геном HCV представлений одноцепочечной позитивно зарядженої РНК, яка кодує 3 структурних (нуклеокапсідний білок core і нуклеопротеїнами оболонки Е1-Е2) і 5 структурних (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) білків. До кожного з цих білків синтезуються АТ, які виявляються в крові хворих на вірусний гепатит С.