Найпоширенішими показаннями до трансплантації рогівки є бульозна кератопатія (псевдофакична, ендотеліальна дистрофія Фукса, афакична), кератоконус, повторна трансплантація тканин, кератит (вірусний, бактеріальний, грибковий, акантамебний, перфораційний) та стромальні дистрофії рогівки.