Мікроделеції сусідніх генів на хромосомі викликають ряд дуже рідкісних синдромів (Прадера-Віллі, Міллера-Дикер, Ді-Джорджі і ін.). Діагностика цих синдромів стала можливою завдяки удосконаленню методики приготування хромосомних препаратів. У разі, якщо мікроделеції не вдається виявити методом каріотипування, використовують ДНК-зонди, специфічні до області, що зазнала делеции.