Мікроделеції сусідніх генів на хромосомі спричиняють низку дуже рідкісних синдромів (Прадера-Віллі, Міллера-Дікера, ДіДжорджа тощо). Діагностика цих синдромів стала можливою завдяки вдосконаленню методу приготування хромосомних препаратів. Якщо мікроделецію неможливо виявити за допомогою каріотипування, використовуються ДНК-зонди, специфічні для ділянки, яка була делетована.