Провідною причиною пошкодження слизової оболонки рота та глотки є інфекція. Однак слід зазначити, що біль у горлі може бути викликаний і неінфекційними факторами: механічними пошкодженнями, впливом тютюнового диму, вдиханням забрудненого або переохолодженого повітря, голосовим напруженням, стороннім тілом у горлі, травмою горла, а також захворюваннями інших органів і систем.