Менінгококи – це грамнегативні кулясті клітини діаметром 0,6-0,8 мкм. У мазках, приготованих з матеріалу, взятого у хворого, вони мають форму кавового зерна, часто розташовуються парами або тетрадами, або хаотично, часто всередині лейкоцитів – неповний фагоцитоз.