На МРТ оцінюють стан структур головного мозку по їх контурах, розмірами і щільності тканини. Необхідно врахувати, що МРТ відображає щільність тканин в залежності від вмісту в них води, і тому в першу чергу виявляють такі ураження, як набряк-набухання головного мозку (ННГМ), демієлінізуючі захворювання, пухлини.