Все пробіотики діляться на кілька груп залежно від того, що лежить в основі класифікації. До складу пробіотика може входити кілька компонентів, в зв'язку з цим виділяють монокомпонетние препарати, які мають тільки один певний вид бактерій. Ці мікроорганізми є, безсумнівно, корисними для кишечника, зокрема, для мікрофлори.