Найчастіше псевдомембранознийколіт розвивається під впливом тривалого застосування антибіотиків ампіциліну, лінкоміцину, клінда-мицин, цефалоспоринів, рідше - пеніциліну, еритроміцину, левоміцетину, тетрацикліну. Clostridium difficile - спороутворююча грамположительная анаеробна паличка, яка здатна до продукції двох видів екзотоксинів токсину А і токсину В. Існують чотири основні причини розвитку псевдомембранозного коліту, пов'язаного з С. Difficile.