Первинний хронічний дуоденіт зустрічається дуже рідко. Основними факторами, що його викликають, є нерегулярне харчування, часте вживання гострої, грубої їжі, міцних алкогольних напоїв, надмірна кількість жирів, вуглеводів; куріння; надмірне захоплення кавою, міцним чаєм.