Деякі типи аутоімунного гепатиту не мають чітко встановленої причини, інші пов'язані з відомими агентами, такими як тіеніловая кислота (діуретик), або із захворюваннями, наприклад з гепатитом С і D. У цілому при аутоімунному гепатиті невідомої етіології спостерігається більш яскрава клінічна картина, для нього характерна більш високі активність сироваткових трансаміназ і рівень у-глобуліну; гістологічні зміни тканини печінки свідчать про більш високу активність, ніж у випадках з відомою етіологією, а відповідь на терапію кортикостероїдами краще.
