Лікування менінгококової інфекції залежить від клінічної форми захворювання. При назофарингіті терапія симптоматична. Якщо діагноз підтверджено бактеріологічно, застосовують бензилпеніцилін, ампіцилін, цефалоспорини першого та другого поколінь, хлорамфенікол, пефлоксацин у середніх терапевтичних дозах протягом 3 днів. Не слід застосовувати ко-тримоксазол та аміноглікозиди, до яких стійкі більшість існуючих на даний момент штамів менінгокока.