Лікування менінгококової інфекції залежить від клінічної форми хвороби. При назофарингіт терапія симптоматична. Якщо діагноз підтверджений бактеріологічно, застосовують бензилпеніцилін, ампіцилін, цефалоспорини I-II покоління, хлорамфенікол, пефлоксацин в середніх терапевтичних дозах протягом 3 діб. Не слід використовувати котрімоксазол, аміноглікозиди, до яких більшість нині існуючих штамів менінгококів стійкі.