H. Influenzae - грамнегативні плеоморфние паличкоподібні або кокковидной клітини розміром (0,2-0,3) х (0.5-2) мкм. Вони розташовані в мазках поодинці або парами, а іноді у вигляді коротких ланцюжків і груп. На щільних середовищах утворюють дрібні (діаметром до 1 мм) круглі безбарвні колонії. Мікроорганізми нерухомі, спор не утворюють, але можливе утворення капсулярних форм, з якими пов'язують патогенні властивості. Збудник продукує ендотоксин, носієм якого вважають капсульні полісахариди.