Настає в результаті недостатньої стимуляції функції яєчників гонадотропними гормонами (ГГ) гіпофіза. Знижена або неадекватна секреція ГГ гіпофізом може спостерігатися при ураженні його гонадотрофов або при зниженні стимуляції гонадотрофов люліберіном гіпоталамуса, т. Е. Вторинна гіпофункція яєчників може бути гипофизарного генезу, гипоталамического і, частіше, змішаного - гіпоталамо-гіпофізарного.