У деяких випадках, частіше у жінок, гострий пієлонефрит починається з гострого циститу (прискорене і хворобливе сечовипускання, болі в області сечового міхура, термінальна гематурія). Інші симптоми гострого міелонефріта: загальна розбитість, слабкість, м'язовий та головний біль, відсутність апетиту, нудота, блювота.