Хронічний гепатит В з дельта-агентом протікає в більшості випадків важче, ніж неускладнений вірусом дельта. Є дані, що вказують на те, що фактори вірусу (генотип), можливо, багато в чому визначають перебіг хвороби. В цілому, на відміну від хронічного гепатиту В і віруусного гепатиту С, при яких як мінімум 70-50% хворих проживають своє життя без формування цирозу печінки, у 100% хворих на хронічний вірусний гепатит D протягом 15-30 років від моменту інфікування цироз печінки неминуче розвивається при відсутності лікування.